Cadis Etrama di Raizel yang “Noblesse”, juga dikenal sebagai “Rai”, didaftarkan di SMA Ye Ran oleh pelayannya Frankenstein untuk tetap bersembunyi dari pandangan Union, sebuah organisasi misterius yang mencari darah Rai. Rai memulai kehidupannya sebagai seorang pelajar, menjadikan dirinya akrab dengan teman-teman sekelasnya dan aktivitas manusia sehari-hari. Namun, kehidupan barunya jauh dari damai, dan Rai terpaksa menyelamatkan teman-teman barunya dari tangan Union yang menculik mereka.
Sementara itu, M-21—seorang agen Union yang menjadi nakal selama operasi penyelamatan Rai—bergabung dengan staf keamanan SMA Ye Ran setelah mendapat usul dari direktur sekolah, yang kebetulan tidak lain adalah Frankenstein sendiri. Di permukaan, M-21 adalah pegawai yang baik dan sopan, namun sebenarnya dia terbelenggu oleh ikatannya dengan Union dan konsekuensi yang tak terelakkan dari pengkhianatan terhadap organisasi.
Untuk lebih memperumit masalah, Bangsawan Regis K. Landegre dan Seira J. Loyard mendaftar di sekolah yang sama untuk menyelidiki Noblesse. Saat Union melakukan perburuan terhadap M-21 untuk mendapatkan petunjuk mengenai agen mereka yang hilang, Rai terpaksa menyembunyikan identitasnya sekaligus melindungi semua yang dia sayangi.
